福州东南眼科医院是三级眼科专科医院。医院设有白内障超声乳化、全飞秒激光治疗近视、青光眼、角膜病、眼底病、眼外伤、玻璃体视网膜病、葡萄膜病、神经眼科、眼遗传病、眼整形、眼眶病、眼眶肿瘤、泪器病、眼表疾病、斜视弱视、小儿眼科、医学验光配镜、中医眼科、低视力康复、眼预防保健、眼部整形等二十多个专业组，与国际同步开展各种眼科前沿技术和微创治疗。其中，全飞秒激光治疗近视、微小切口超声乳化治疗白内障、微创玻璃体切割手术治疗眼外伤和玻璃体视网膜病、眼视光学医学验光配镜等多项技术处于目前眼科领域的前沿，具有眼科专业精细化、医生专业化、设备现代化、服务人性化、价格平民化的专科特色。 福州东南眼科医院坚持谋求社会责任与自身发展的和谐统一，积极倡导和参与眼科防盲、保健、诊疗等公益活动，是地方重大公共卫生项目“百万贫困白内障患者复明工程”和福建省委省政府为民办实事“光明行动”项目的定点医院、福建省红十字光明天使行动定点医院、福建省见义勇为人员眼科救治中心、福建省眼镜协会验光配镜技术培训和鉴定基地、福建省住院医师规范化培训基地、福建省卫生职业技术学院教学医院、省市两级科普教育基地、福州市慈善定点医院、福州市低视力康复部、福州市青少年学生第二课堂，是福州市医学会眼科学分会主任委员单位。
